新生儿黄疸是新生儿期常见的现象，约60%足月儿和80%早产儿会出现生理性黄疸。其主要原因分为生理性和病理性两类。
生理性黄疸的原因
胆红素生成过多： 新生儿红细胞数量多且寿命短，相比成人更容易被破坏，这样就会产生更多的胆红素。新生儿肝脏对胆红素的代谢能力还不完善，使得胆红素产生量超过了肝脏的处理能力，从而引发黄疸。一般足月儿生理性黄疸在出生后2 - 3天出现，4 - 5天达到高峰，7 - 10天消退；早产儿则多于出生后3 - 5天出现，5 - 7天达高峰，7 - 9天消退，最长可延迟到3 - 4周消退。肝脏胆红素代谢障碍： 新生儿肝脏内摄取胆红素的Y、Z蛋白含量低，在出生后1周左右才达到成人水平。同时，肝脏中尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）的量及活性不足，使得肝脏对胆红素的结合能力受限。另外，新生儿肝脏排泄胆红素的功能也不完善，容易导致胆红素在体内堆积，引发黄疸。
病理性黄疸的原因
胆红素生成过多： 常见于红细胞增多症，比如分娩过程中胎盘血管畸形、双胎输血等情况，会使新生儿红细胞数量过多，破坏后产生大量胆红素。还有血型不合溶血病，像ABO血型不合或Rh血型不合，母亲和胎儿血型不同，母亲的抗体通过胎盘进入胎儿体内，破坏胎儿红细胞，产生大量胆红素，这种情况黄疸出现时间早，一般在出生后24小时内就会出现，而且进展迅速。肝脏胆红素代谢障碍： 新生儿肝炎综合征就是其中一种情况，多由病毒感染引起，如乙肝病毒、巨细胞病毒等，病毒感染导致肝细胞受损，影响肝脏对胆红素的摄取、结合和排泄功能。先天性胆道闭锁也是重要原因，胆道闭锁使得胆红素排泄受阻，胆红素堆积在体内，引起黄疸，这种情况一般在出生后2周左右出现黄疸，并进行性加重。胆汁排泄障碍： 新生儿胆汁排泄障碍可能是由于遗传因素导致的胆管发育异常，或者是在围生期有缺氧、感染等情况影响了胆汁的排泄。比如新生儿胆汁黏稠综合征，由于各种原因导致胆汁黏稠，排泄不畅，胆红素排泄受阻，从而引发黄疸。