软组织损伤的治疗方法需根据损伤的程度等因素来定。一般来说，轻度的软组织损伤可以通过早期冷敷、后期热敷等方法来处理。
早期急救处理
冷敷： 在软组织损伤后的24~48小时内，可进行冷敷。用冰袋或冷毛巾敷在损伤部位，每次敷15~20分钟，每天可敷3~4次。冷敷能收缩血管，减少局部出血和肿胀。比如脚踝扭伤后，马上用冷水浸泡或用冰袋冷敷受伤的脚踝部位。制动休息： 受伤后要让受伤部位休息，避免继续活动加重损伤。像肌肉拉伤后，就不要再继续使用受伤的肌肉部位进行运动。
药物治疗
非甾体抗炎药： 若疼痛较为明显，可使用非甾体抗炎药，如布洛芬等。这类药物能减轻炎症反应和疼痛，但要注意，有消化道溃疡等疾病的患者使用时需谨慎，需在医生指导下用药。活血化瘀的中药： 一些活血化瘀的中药外用药也可用于软组织损伤，比如云南白药膏等。它能促进局部血液循环，帮助消肿止痛。不过对药物过敏的人不能使用。
康复治疗
物理治疗： 当损伤处于恢复期时，可进行物理治疗，如红外线照射。红外线照射能促进局部血液循环，加速组织修复。一般每次照射15~20分钟，每天1~2次。还有超声波治疗，也能促进软组织的修复。康复锻炼： 在损伤逐渐恢复后，要进行适当的康复锻炼。比如膝关节软组织损伤恢复中期，可以进行膝关节的屈伸锻炼，但要注意锻炼的幅度和强度要逐渐增加，避免再次损伤。像刚开始可以小范围地屈伸膝关节，随着恢复情况逐渐增大活动范围。
手术治疗情况
严重损伤： 如果软组织损伤非常严重，如大面积的肌肉断裂、肌腱完全断裂等情况，可能需要进行手术治疗。例如跟腱完全断裂，就可能需要通过手术来修复跟腱，恢复其正常功能。但手术治疗后也需要长时间的康复训练来恢复受伤部位的功能。