三个月不来月经且未怀孕可能与以下因素有关：
一、多囊卵巢综合征：
1.该病症会致使体内雄性激素分泌增多，进而引发月经不调，出现三个月不来月经的情况，同时还可能伴有不排卵、不孕等表现。
2.诊断方面，建议进行B超检查和激素六项检查。
3.治疗上，需要在医生指导下使用药物，如炔雌醇环丙孕酮片、屈螺酮炔雌醇片等。
二、宫腔粘连：
1.若有过人工流产、宫腔镜手术等经历，术后卫生不佳，可能引起宫内感染，导致宫腔粘连，使经血无法排出体外。
2.可通过宫腔镜检查来明确是否是宫腔粘连导致的三个月不来月经。
3.治疗时需进行宫腔镜手术，术后在医生指导下应用头孢拉定、阿莫西林等抗生素。
三、卵巢功能减低：
1.经常熬夜、过度劳累等会影响卵巢功能，导致其功能减低。
2.由于卵巢功能减低会引起雌激素缺乏，造成子宫内膜变薄，从而引起三个月不来月经。
3.应抽血检查激素六项，可在医生指导下适当服用戊酸雌二醇、雌三醇等进行调理。
综上所述，当出现三个月不来月经且未怀孕的情况时，可能是多囊卵巢综合征、宫腔粘连、卵巢功能减低等原因所致，需要通过相关检查明确具体病因，并在医生指导下进行针对性治疗。