白塞病的具体病因目前还不完全明确，但研究认为可能与遗传、感染等因素有关。一般来说，白塞病的发生是多种因素共同作用的结果。
遗传因素相关情况
基因携带倾向：白塞病具有一定的遗传易感性，有研究发现某些基因的携带可能会增加患白塞病的风险。比如人类白细胞抗原（HLA）-B51基因，在白塞病患者中的阳性率明显高于正常人群。不过，并非携带这些基因就一定会发病，只是相对来说发病的几率会比没有携带相关基因的人高一些。
感染因素方面
病毒感染影响：某些病毒可能与白塞病的发病有关。例如单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等。有研究推测，病毒感染可能会触发人体的免疫反应，导致自身免疫系统紊乱，进而引发白塞病。当人体感染了这些病毒后，免疫系统错误地将自身组织当作外来病原体进行攻击，就可能逐步导致白塞病相关症状的出现。细菌感染关联：一些细菌感染也被认为可能和白塞病的发生有联系。比如链球菌、结核杆菌等感染。当人体受到这些细菌感染后，免疫系统被激活，在对抗细菌感染的过程中，可能会出现免疫调节失衡，从而诱导白塞病的发生。例如结核杆菌感染，有部分白塞病患者在发病前有过结核感染的情况，经过抗结核治疗后，白塞病的症状可能会有所缓解。
免疫异常情况
免疫系统紊乱表现：白塞病患者存在明显的免疫异常。人体的免疫系统正常情况下可以识别和清除外来病原体，但在白塞病患者体内，免疫系统出现了失调。T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞功能异常，导致机体产生过多的自身抗体和炎症因子。这些异常的免疫反应会攻击血管等组织，引起血管炎等一系列病理改变，从而出现白塞病的各种症状，像口腔溃疡、生殖器溃疡、眼部炎症等表现都与这种免疫异常导致的血管炎相关。