治疗肠炎并没有绝对最有效的单一药物，需根据肠炎类型等因素选择。比如感染性肠炎常用抗生素等药物，一般来说感染性肠炎可在医生指导下使用诺氟沙星等药物，但具体效果因个体和病情而异。
感染性肠炎用药
细菌感染性肠炎：如果是细菌感染引起的肠炎，常用喹诺酮类药物，像诺氟沙星，它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥抗菌作用。但需要注意18岁以下青少年禁止使用诺氟沙星，因为可能影响软骨发育。病毒感染性肠炎：对于病毒感染导致的肠炎，目前没有特效抗病毒药物，多以对症支持治疗为主。比如轮状病毒肠炎，主要是补充水分和电解质，防止脱水。
非感染性肠炎用药
炎症性肠病：像溃疡性结肠炎，常用氨基水杨酸制剂，如柳氮磺吡啶，它在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制肠黏膜的前列腺素合成和白三烯释放，从而减轻炎症反应。不过柳氮磺吡啶可能会引起恶心、呕吐等不良反应，对磺胺类药物过敏者禁用。缺血性肠炎：缺血性肠炎主要是改善肠道供血，比如使用扩张血管的药物，但是具体药物使用需根据患者病情由医生精准判断，这类患者往往有基础疾病，如心血管疾病等，用药需特别谨慎。
对症治疗药物
止泻药物：如果肠炎患者腹泻严重，可使用蒙脱石散，它能在肠道内形成一层保护膜，吸附肠道内的病菌和毒素，起到止泻作用。一般成人每次服用1袋（3克），儿童需根据年龄减量使用，但过量服用可能引起便秘。调节肠道菌群药物：比如双歧杆菌三联活菌胶囊，它含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌等有益菌，能调节肠道菌群平衡，改善肠道功能。不过该药物需冷藏保存，且应避免与抗菌药物同时服用，否则会影响疗效。