嘴巴长溃疡的原因有多种，比如复发性阿弗他溃疡，其发病率较高，有资料显示约10% - 25%的人会受到复发性阿弗他溃疡的困扰。
一、局部创伤因素
口腔内咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就容易引发溃疡。要是咬伤的伤口较深，愈合时间可能会相对长一些，而且在此期间溃疡处会有疼痛不适的感觉。尖锐牙尖刺激： 口腔里如果有比较尖锐的牙尖，长期摩擦口腔黏膜，也会导致溃疡产生。比如有的牙齿因为龋齿等原因形成了锐利的边缘，就会不断刺激周围组织。
二、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B族时，像维生素B2、B6等缺乏，就容易长口腔溃疡。一般来说，均衡饮食的人通过正常饮食能获取足够的维生素，但如果长期挑食、偏食，就可能导致维生素摄入不足。例如长期只吃精米白面，而蔬菜、粗粮摄入过少的人，就容易出现维生素B族缺乏。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素的缺乏也和口腔溃疡有关系。锌参与人体很多重要的生理过程，缺乏锌时，会影响细胞的正常代谢，从而增加口腔溃疡发生的几率。比如一些素食者，由于植物性食物中锌的吸收利用率相对较低，就可能面临锌缺乏的风险。
三、免疫系统因素
免疫力下降时易发病： 当人体免疫力下降时，比如熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病等情况，就容易让口腔内原本潜伏的病毒或细菌活跃起来，引发口腔溃疡。像经常熬夜的人，身体处于疲劳状态，免疫力降低，就比作息规律的人更易长溃疡。自身免疫性疾病相关： 一些自身免疫性疾病也可能伴有口腔溃疡的症状，比如白塞病，除了口腔溃疡外，还可能出现眼部病变、生殖器溃疡等表现。不过白塞病相对比较少见，但也是导致口腔溃疡的一个原因。