矮小症的成因较为复杂，主要由以下几方面原因导致。一般来说，矮小症可能由遗传因素、内分泌疾病、慢性疾病等多种原因引起。
遗传因素导致
基因遗传： 如果父母双方身材矮小，那么孩子遗传矮小的概率会相对较高。比如父母身高都低于正常范围，孩子出生后身高增长可能就会受到遗传影响，出现矮小的情况。家族遗传倾向： 一些家族中存在矮小症的遗传倾向，可能是特定的基因缺陷导致孩子从家族中继承了矮小的“特质”，使得孩子的生长发育偏离正常身高增长曲线。
内分泌疾病引发
生长激素缺乏： 生长激素是促进人体生长的重要激素，如果垂体分泌生长激素不足，就会影响身高增长。例如垂体发育异常等情况可能导致生长激素分泌减少，从而引发矮小症。甲状腺功能减退： 甲状腺分泌的甲状腺激素对生长发育也至关重要，当甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会使孩子的生长速度减慢，出现身材矮小的状况，同时还可能伴有智力发育迟缓等表现。
慢性疾病影响
营养不良相关： 长期营养不良会影响孩子的身高发育。比如孩子饮食中缺乏蛋白质、维生素、矿物质等营养物质，像蛋白质摄入不足会影响身体组织的合成，从而阻碍身高增长。慢性肾病： 患有慢性肾病的孩子，由于肾脏功能受损，会影响体内激素的代谢和营养物质的吸收等，进而影响生长发育，导致身材矮小。例如一些慢性肾炎患儿，身高增长往往低于正常儿童。先天性心脏病： 先天性心脏病会影响孩子的身体血液循环和营养供应，长期的心脏功能异常会使孩子的生长发育受到限制，出现矮小的情况。
其他因素作用
宫内发育迟缓： 胎儿在宫内发育时，如果受到母体因素影响，如母体妊娠期患有高血压、贫血等疾病，或者吸烟、酗酒等不良行为，可能导致胎儿宫内发育迟缓，出生后身高就比正常胎儿偏低，后续身高增长也可能受限。精神因素： 长期处于精神压抑的环境中，也可能影响孩子的生长激素分泌，从而影响身高。比如家庭关系不和睦、学习压力过大等精神因素，可能会干扰孩子的内分泌功能，导致身材矮小。