治疗脑梗并没有绝对效果最好的药物，需根据不同病情阶段选择合适药物。一般在发病4.5小时内符合溶栓指征的患者，可使用重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）进行静脉溶栓，这是目前较有效的恢复血流措施之一。
溶栓类药物：
rt-P
A： 是一种特异性较强的纤溶酶原激活剂，能选择性地激活血栓中的纤溶酶原，使之转变为纤溶酶，从而溶解血栓，恢复脑血流。但使用有严格时间窗限制，必须在发病4.5小时内应用。尿激酶： 也可用于溶栓治疗，通过激活体内纤溶酶原成为纤溶酶，降解纤维蛋白，达到溶解血栓的目的，不过同样需要把握好用药时机。
抗血小板聚集药物：
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集。一般建议脑梗患者长期小剂量服用，能降低脑梗复发风险。但有消化道溃疡、出血倾向等患者需谨慎使用。氯吡格雷： 作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林的患者可选用，或在某些情况下与阿司匹林联合使用（如急性冠脉综合征的双联抗血小板治疗）。
神经保护类药物：
依达拉奉： 是一种自由基清除剂，可清除脑内的羟自由基等有害自由基，减轻脑梗死引起的神经细胞损伤、脑水肿和改善认知功能障碍。常用于急性脑梗死患者的神经保护治疗，能一定程度上改善患者预后。胞磷胆碱钠： 可以增强脑干网状结构上行激活系统的机能，增强锥体系统的机能，改善运动麻痹，促进大脑功能恢复和促进苏醒。对脑梗后的神经功能恢复有一定帮助。
控制脑水肿药物：
甘露醇： 是常用的脱水降颅压药物，通过提高血浆渗透压，使脑组织内的水分向血浆转移，从而减轻脑水肿，降低颅内压。但长期或大量使用可能会引起电解质紊乱等不良反应，需密切监测患者电解质情况。甘油果糖： 也是一种脱水剂，通过高渗脱水，使脑水分含量减少，降低颅内压。其作用相对温和，对肾功能影响较小，适用于肾功能不全或需要长期脱水降颅压的脑梗患者。