脱肛的原因有多种，其中盆底组织薄弱是常见因素之一，约有30% - 40%的脱肛患者存在盆底肌肉或筋膜等支持结构的薄弱情况。
解剖结构异常方面
先天性发育不全： 婴幼儿时期，身体的骶骨弯曲度尚未形成正常的生理曲线，直肠呈垂直状态，且周围的支持组织相对薄弱，这使得婴幼儿比较容易发生脱肛。一般来说，婴幼儿脱肛在5岁前有自愈的可能，但如果超过5岁仍未改善则需要干预。直肠黏膜松弛： 随着年龄增长，直肠黏膜会逐渐出现松弛的情况，尤其是一些中老年人，由于长期的腹压增加或者身体机能衰退，直肠黏膜松弛后就容易发生脱肛。
腹压增加因素
长期便秘： 长期便秘的人，在排便时需要用力屏气，这会导致腹压升高，长时间的腹压升高会对直肠造成向下的压力，从而引发脱肛。有研究表明，便秘患者中约15% - 20%会出现脱肛症状。慢性腹泻： 慢性腹泻会频繁刺激直肠，使直肠黏膜受到损伤，同时也会导致腹压反复波动升高，增加脱肛的发生风险。例如，一些患有慢性肠炎的患者，长期腹泻就比较容易出现脱肛情况。重体力劳动： 从事重体力劳动的人，在用力劳作时腹压会明显升高，像建筑工人、搬运工等，长期的重体力劳动会使直肠承受较大的向下的压力，久而久之就可能引发脱肛。
其他因素
手术损伤： 直肠肛管部位的手术，如果操作不当，可能会损伤到直肠周围的支持组织，从而导致脱肛。比如一些直肠癌手术，在切除肿瘤的过程中，如果破坏了直肠周围的肌肉等结构，就有可能引发脱肛。神经系统病变： 一些神经系统的疾病，如脊髓空洞症、多发性硬化等，会影响到肛门周围肌肉的神经支配，导致肌肉功能失调，进而引发脱肛。这类情况相对较少见，但一旦出现也需要针对神经系统疾病进行相应治疗来改善脱肛状况。