目前治疗脑梗塞并没有绝对最好的药，一般在发病4.5小时内可以考虑使用阿替普酶进行静脉溶栓治疗，这是目前较为有效的恢复血流的措施之一。
溶栓类药物
阿替普酶： 是一种重组组织型纤溶酶原激活剂，能特异性地激活血栓中的纤溶酶原，使之转化为纤溶酶，从而溶解血栓。它需要在发病4.5小时内应用，能显著降低脑梗塞患者的致残率和死亡率，但使用有严格的适应症和禁忌症，比如近期有严重出血倾向、颅内出血病史等情况不能使用。
抗血小板聚集药物
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集。一般建议脑梗塞患者在没有禁忌证的情况下长期服用，能降低脑梗塞的复发风险。但有胃肠道出血病史、严重肝肾功能不全等情况要慎用。氯吡格雷： 也是常用的抗血小板药物，作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林的患者可以选用，同样也有出血等不良反应的风险。
神经保护类药物
依达拉奉： 是一种自由基清除剂，能抑制脂质过氧化，从而抑制脑细胞、血管内皮细胞、神经细胞的氧化损伤。可用于改善急性脑梗塞所致的神经症状、日常生活活动能力和功能障碍。常见不良反应有肝功能异常等，肾功能不全的患者要谨慎使用。胞磷胆碱钠： 可以增强脑干网状结构上行激活系统的机能，增强锥体系统的机能，改善运动麻痹，对促进大脑功能恢复、促进苏醒有一定作用。适用于急性脑梗塞引起的神经系统症状的改善。