目前治疗脑梗并没有绝对“最好”的药，需根据不同病情阶段来选择合适药物。一般在发病4.5小时内符合溶栓指征的患者，可考虑使用阿替普酶进行静脉溶栓治疗，这是目前较有效的恢复血流的措施之一。
急性脑梗的溶栓药物
阿替普酶： 是一种重组组织型纤溶酶原激活剂，能选择性地激活血栓中的纤溶酶原，使之转化为纤溶酶，从而溶解血栓，恢复梗死区域的血液供应。但使用有严格时间窗限制，通常是发病后4.5小时内。尿激酶： 也是常用的溶栓药物，可直接作用于内源性纤维蛋白溶解系统，促进纤溶酶原转变为纤溶酶，起到溶栓作用，不过其溶栓效果及安全性等方面与阿替普酶有一定差异，使用也需把握好时机。
脑梗的抗血小板药物
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集。一般建议脑梗患者长期小剂量服用，能降低脑梗复发风险，但部分人可能会有胃肠道不适等副作用，如出现胃痛、恶心等要及时就医。氯吡格雷： 作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林或有其他情况的患者可选用，同样要注意可能出现的出血等不良反应。
脑梗的神经保护药物
依达拉奉： 是一种自由基清除剂，能抑制脂质过氧化，从而抑制脑细胞、血管内皮细胞、神经细胞的氧化损伤。可用于改善急性脑梗患者的神经功能缺损症状，在脑梗发病后尽早使用效果相对较好。胞磷胆碱钠： 可以改善脑代谢，促进大脑功能恢复，对脑梗引起的神经功能障碍有一定的修复作用，能帮助患者恢复部分神经功能，提高生活质量。