反流性食管炎主要是由于抗反流屏障结构与功能异常、食管清除作用降低以及食管黏膜屏障功能降低等多种因素引起。据研究，大约有40%的反流性食管炎患者存在下食管括约肌压力降低的情况。
抗反流屏障结构与功能异常方面
下食管括约肌压力降低： 正常情况下，下食管括约肌能防止胃内容物反流。当它的压力降低时，就容易让胃内容物反流至食管，比如一些肥胖人群，体内脂肪堆积可能影响下食管括约肌的正常功能，导致其压力下降，增加反流性食管炎的发病风险。食管裂孔疝： 食管裂孔疝是指部分胃组织通过食管裂孔进入胸腔。这会改变下食管括约肌的正常解剖结构，削弱抗反流屏障，使得胃内容物更容易反流到食管，从而引发反流性食管炎。
食管清除作用降低方面
正常食管蠕动功能障碍： 食管蠕动可以将反流的胃内容物及时清除。如果食管蠕动功能出现障碍，比如老年人食管蠕动能力下降，就会影响对反流物的清除速度，使得反流物在食管内停留时间延长，刺激食管黏膜，引发炎症，增加反流性食管炎的发生几率。唾液分泌减少： 唾液有中和胃酸、清除反流物的作用。当唾液分泌减少时，比如一些药物副作用导致唾液分泌受影响，就会降低食管对反流物的清除能力，进而容易诱发反流性食管炎。
食管黏膜屏障功能降低方面
长期吸烟、饮酒： 吸烟会降低食管下括约肌压力，还会减少食管黏膜血流量，影响食管黏膜的防御功能；饮酒也会刺激食管黏膜，破坏食管黏膜屏障，使食管更容易受到反流物的损伤，增加反流性食管炎的发病可能性。某些食物影响： 长期食用高脂肪饮食，会延缓胃排空，导致胃内压力升高，促进反流；过食巧克力、咖啡等，其中的成分也可能削弱食管黏膜屏障，增加反流性食管炎的发生风险。