三个月的宝宝睡觉前老是摇头，可能与以下原因有关。
1.生理因素
环境温度：宝宝头部容易出汗，如果室内温度过高、被子过厚，会导致宝宝头部不适，从而出现摇头的现象。
睡前兴奋：如果宝宝在睡前过于兴奋，大脑皮质的神经细胞会处于兴奋状态，可能会导致宝宝出现摇头、蹬腿等动作。
习惯动作：宝宝可能会通过摇头来探索周围环境，或者是一种自我安抚的方式。
2.皮肤问题
湿疹：宝宝的头皮如果出现湿疹，会导致瘙痒，从而使宝宝通过摇头来缓解不适。
痱子：宝宝的头部如果出汗过多，容易出现痱子，也会引起瘙痒，导致宝宝摇头。
3.维生素D缺乏性佝偻病
维生素D缺乏性佝偻病的宝宝，由于血钙降低，会引起神经兴奋性增高，导致宝宝出现多汗、摇头、烦躁、睡眠不安等症状。
4.中耳炎
如果宝宝患有中耳炎，会出现耳部疼痛，宝宝会通过摇头来缓解耳部不适。
如果宝宝只是偶尔摇头，没有其他异常表现，精神状态良好，家长可以先观察。如果宝宝摇头频繁，同时伴有多汗、烦躁、哭闹等症状，或者出现了其他异常表现，建议及时带宝宝就医，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。