肾输尿管结石主要症状表现多样，其中疼痛较为常见，约有半数以上患者会出现腰部或上腹部疼痛。当结石活动引起输尿管梗阻时，疼痛会比较剧烈，呈阵发性绞痛，可放射至下腹部、腹股沟及会阴部等部位，疼痛发作时患者往往难以忍受。
疼痛表现
肾绞痛： 多在活动、劳累或乘车颠簸后发作。疼痛性质为突发的剧烈绞痛，如刀割样，患者常辗转不安。这种疼痛可能会持续数分钟到数小时不等。钝痛： 部分患者表现为腰部或上腹部的隐痛、胀痛，多是由于结石导致肾盂或输尿管轻度扩张引起的。
血尿症状
肉眼血尿： 有的患者可出现肉眼可见的血尿，尿液颜色呈洗肉水样或鲜红色。一般在活动后血尿会加重。镜下血尿： 更多见的是镜下血尿，即通过显微镜检查尿液时发现有红细胞。大约有80%的患者会出现血尿，尤其是在疼痛发作后血尿更易出现。
其他伴随症状
排尿不适： 结石如果向下移动，可能会引起尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。这是因为结石刺激输尿管膀胱壁段，导致膀胱痉挛。恶心呕吐： 肾输尿管结石引起剧烈疼痛时，常常会伴有恶心、呕吐症状，这是由于疼痛刺激了消化道神经，引起反射性呕吐。患者呕吐后疼痛症状可能不会立即缓解。感染表现： 如果结石合并感染，还会出现发热、寒战等全身症状，同时尿液中白细胞会增多，尿培养可能会有细菌生长。