胆固醇低可能由多种原因引起，比如一些疾病因素，像甲状腺功能亢进症，患者体内甲状腺激素分泌过多，会加快机体代谢，影响胆固醇的合成与代谢，有研究显示约30% - 50%的甲状腺功能亢进症患者会出现胆固醇水平降低；还有肝脏疾病，如重症肝炎、肝硬化等，肝脏是合成胆固醇的重要场所，肝脏病变会影响胆固醇的合成过程，导致胆固醇降低。
饮食因素导致胆固醇低
长期节食或营养不良：如果长期摄入的食物中胆固醇及脂肪含量过低，就会使体内胆固醇合成原料不足。比如有些人为了减肥过度节食，每天摄入的食物热量极低，其中涉及胆固醇合成的营养物质匮乏，就可能造成胆固醇水平降低。一般建议每天从食物中摄取一定量的胆固醇，正常成年人每天胆固醇的适宜摄入量约为300毫克，如果长期低于这个合理范围，就可能出现胆固醇低的情况。
生活方式相关因素
过度运动：长时间、高强度的运动可能会影响体内脂质代谢。当运动量过大时，身体消耗的能量增多，会加速体内脂肪包括与胆固醇相关的物质的分解代谢，从而导致胆固醇水平下降。一般来说，每周运动3 - 5次，每次30分钟以上属于较为合理的运动强度，如果运动强度远超这个范围，就需要考虑对胆固醇水平的影响。
药物影响导致胆固醇低
某些降胆固醇药物过量：虽然这类药物主要是用于降低胆固醇，但如果使用不当过量服用，可能会进一步降低体内胆固醇水平。例如他汀类药物，它通过抑制胆固醇合成过程中的关键酶来发挥作用，如果过量服用，就可能使胆固醇降低过度。所以在使用这类药物时，必须严格遵循医嘱，按照规定的剂量和疗程使用。