胃不舒服时吃益生菌是否有效需依具体病症判断。若由胃肠功能减弱、免疫力低下、消化不良、胃肠道炎症等引发可使用益生菌，而由消化道溃疡伴出血、急性胃炎伴活动出血等引发则不可使用。
一、胃肠功能减弱、免疫力低下、消化不良、胃肠道炎症等引发的胃不舒服，使用益生菌有效。
1.益生菌可合成消化酶，并刺激胃肠道分泌消化酶，促进胃肠道营养吸收，能缓解消化不良和胃肠功能减弱症状。
2.刺激机体免疫系统，提升机体免疫力，对免疫力低下人群有良好治疗作用。
3.降低肠道黏膜渗透性，保护肠黏膜屏障完整性，抑制肠道炎症反应，可辅助治疗肠道炎症。此外，便秘和腹泻人群搭配使用益生菌，可增强肠道菌群平衡，缓解症状。
二、其他胃部疾病引发的胃不舒服不能使用益生菌。
1.如消化道溃疡伴有出血、急性胃炎伴有活动性出血等疾病，大量益生菌可能经出血部位进入血液循环，引发菌血症，出现高热、寒颤等症状。
2.针对消化系统出血患者需及时输血补液，采取止血措施，如镜下喷洒止血粉、介入治疗等，后期还需针对原发病治疗，如使用抑制胃酸分泌药物如奥美拉唑、雷尼替丁、法莫替丁等。
三、对乳糖和果糖过敏人群不能使用益生菌，因其含果糖和乳糖成分，易诱发过敏反应。
总之，胃不舒服能否使用益生菌要根据具体病因来判断，不能一概而论，且使用时需注意相关禁忌情况。