乙肝大三阳是由乙肝病毒（HBV）感染引起的。乙肝病毒主要通过血液、母婴和性接触传播。例如，母婴传播中，乙肝表面抗原（HBsAg）、e抗原（HBeAg）及核心抗体（HBcAb）三项阳性的母亲，在分娩过程中或产后可能将病毒传给婴儿，据统计，这类母婴传播的几率较高。
病毒传播途径：
血液传播： 输入被乙肝病毒污染的血液或血制品，比如过去没有严格筛查血液时，就有因输血感染乙肝的情况；使用被乙肝病毒污染且未经严格消毒的注射器、针头、针灸针等侵入性医疗器具，也会导致病毒传播。母婴传播： 除了分娩时传播，还可能在孕期通过胎盘、产程中以及产后密切接触传播。母亲病毒载量高的话，母婴传播风险更大。性传播： 与乙肝大三阳患者发生无防护的性接触，乙肝病毒可通过性器官黏膜等途径侵入人体导致感染。
人体免疫因素影响：
当人体免疫系统功能较弱时，对乙肝病毒的清除能力下降，就更容易感染乙肝病毒并发展为大三阳。比如儿童免疫系统发育尚不完善，感染乙肝病毒后容易成为慢性携带者，进而发展为大三阳。而成年人免疫系统相对健全，大部分能清除病毒，只有少数免疫功能低下者会慢性化成为大三阳。
病毒自身特性：
乙肝病毒有较强的生存能力和变异性。它可以在肝细胞内长期潜伏，逃避人体免疫系统的清除。病毒的基因结构特点使其容易发生变异，这也增加了乙肝治疗和预防的难度。而且乙肝病毒感染后，会在体内持续复制，不断损害肝细胞，导致肝脏炎症等病变，从而表现为乙肝大三阳的相关症状和体征。