口腔溃疡的引发原因有多种。一般来说，大约20% - 30%的口腔溃疡与遗传因素有关，如果父母双方都有复发性口腔溃疡，子女发病概率会较高。
局部创伤因素
口腔内机械刺激： 比如牙齿的残冠、残根，或者不合适的假牙，长期摩擦口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如牙齿有尖锐的边缘，持续刺激口腔内侧黏膜，可能在1 - 2周内就会形成溃疡。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬伤口腔黏膜，也会导致口腔溃疡。这种情况比较常见，尤其是进食速度快或者咀嚼不细致的时候。
免疫系统问题
自身免疫反应： 当人体免疫系统出现紊乱时，就容易攻击自身的口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡。例如，患有白塞病时，口腔溃疡往往是比较典型的症状之一，而且容易反复发作。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如感冒、过度疲劳、睡眠不足等情况下，口腔黏膜的抵抗力下降，就容易受到病原体的侵袭，引发口腔溃疡。一般来说，连续熬夜2 - 3天，就可能增加口腔溃疡的发生风险。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B1、B2、B6、B12等）和维生素C缺乏时，容易引发口腔溃疡。比如长期偏食、挑食的人，摄入富含维生素的蔬菜水果较少，就容易出现这种情况。一般饮食中缺乏维生素的人群，可能在1 - 3个月内逐渐出现口腔溃疡症状。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体很多重要的生理活动，缺乏锌会影响口腔黏膜的修复；铁是合成血红蛋白的重要原料，缺乏铁会影响身体的整体机能，进而可能导致口腔溃疡。