自身免疫性甲状腺炎的治疗需根据不同情况来定。一般来说，若甲状腺功能正常，通常定期复查即可，每6 - 12个月监测甲状腺功能和甲状腺超声。
甲状腺功能正常时的处理
定期监测： 要定期检查甲状腺功能，包括促甲状腺激素（TSH）、甲状腺素（T4）、三碘甲状腺原氨酸（T3）等指标，通过这些指标来观察甲状腺功能有无变化。生活方式调整： 保持健康的生活方式很重要，比如保证充足的睡眠，每天尽量保证7 - 8小时的睡眠时间；还要合理饮食，均衡摄入各类营养物质，像多吃新鲜的蔬菜和水果等。
甲状腺功能减退时的治疗
药物补充甲状腺激素： 常用左甲状腺素钠片来补充甲状腺激素。左甲状腺素钠片可以替代体内不足的甲状腺激素，维持机体正常的代谢功能。定期调整剂量： 需要根据甲状腺功能的检查结果来定期调整左甲状腺素钠片的剂量，一般每4 - 6周可能需要复查甲状腺功能，然后根据TSH等指标来调整用药量，使甲状腺功能维持在正常范围。
甲状腺肿大明显时的处理
评估压迫情况： 如果甲状腺肿大明显，要评估是否有压迫症状，比如压迫气管导致呼吸困难、压迫食管导致吞咽困难等。药物辅助（必要时）： 有时候可能会使用一些药物来缩小甲状腺肿大，比如在某些情况下可能会短期使用糖皮质激素等，但要严格掌握用药指征。手术考虑： 如果甲状腺肿大严重影响外观或者压迫症状明显，经过评估后可能需要考虑手术治疗，但手术是最后的选择，需要谨慎权衡利弊。