头皮毛囊炎通常可以外用抗生素类药物来改善，比如莫匹罗星软膏，一般连续使用几天到一周左右可能会有效果。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 它对革兰阳性球菌有很好的抗菌作用，能抑制细菌蛋白质的合成，从而起到杀菌消炎的效果，可用于治疗细菌感染引起的头皮毛囊炎。一般局部外用，直接涂抹在患处。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌，如金黄色葡萄球菌等有良好的抗菌活性，能渗透进入皮肤，发挥抗菌作用，帮助缓解头皮毛囊炎的红肿、疼痛等症状。
抗真菌类药物
酮康唑洗剂： 如果头皮毛囊炎是由真菌感染引起的，像马拉色菌感染导致的，酮康唑洗剂就比较适用。它可以抑制真菌细胞膜的合成，影响真菌代谢，每周使用2 - 3次，洗头后让洗剂在头皮上停留几分钟再冲洗掉。特比萘芬乳膏： 属于烯丙胺类抗真菌药，能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，影响真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用，对于真菌性头皮毛囊炎有一定疗效，涂抹在头皮患处即可。
中成药类
鱼石脂软膏： 有消肿、防腐及温和的刺激性作用，可促进头皮毛囊炎的局限、穿破，帮助排出脓液等。使用时涂抹在患处，注意不要接触眼睛和其他黏膜部位。如意金黄散： 用醋或白酒调成糊状后涂抹在头皮毛囊炎患处，有清热解毒、消肿止痛的作用，能缓解头皮毛囊炎引起的红肿热痛等症状，但使用前最好咨询医生，根据病情调配合适的糊状浓度等。
日常注意事项配合
在使用药物治疗头皮毛囊炎的同时，还需要注意保持头皮清洁，建议每天用温和的洗发水清洗头发，保持头皮干爽。另外，要避免搔抓头皮，防止感染进一步加重。如果头皮毛囊炎情况较为严重，比如范围大、症状持续不缓解等，还需要及时就医，可能需要结合口服药物等其他治疗方式，但具体用药需遵医嘱，不能自行随意加大药物使用剂量等。