慢性肾盂肾炎的治疗药物选择需根据病情等因素来定，一般常用抗生素类药物。比如对于急性期的慢性肾盂肾炎急性发作，常用喹诺酮类药物，像氧氟沙星等，不过具体用药要遵医嘱。
抗生素药物选择
喹诺酮类药物： 这类药物对肾盂肾炎常见的致病菌有较好的抗菌作用，比如氧氟沙星，它能抑制细菌DNA旋转酶，从而阻碍细菌DNA复制，达到杀菌效果。半合成青霉素类： 像阿莫西林等，可通过抑制细菌细胞壁合成发挥抗菌作用，对部分肾盂肾炎致病菌有效。
针对反复发作情况的药物
长疗程低剂量抑菌疗法： 对于慢性肾盂肾炎反复发作的患者，可采用长疗程低剂量抑菌疗法，一般会选用复方磺胺甲恶唑等药物，通过长期小剂量使用，抑制细菌繁殖，减少复发。比如每晚睡前服用一次，持续较长时间，具体时间需根据病情由医生决定。
合并其他情况的用药考量
伴有基础疾病的情况： 如果患者合并糖尿病等基础疾病，在使用抗生素治疗肾盂肾炎时，要格外注意控制血糖。因为高血糖环境利于细菌生长繁殖，所以要将血糖控制在合适范围，比如空腹血糖控制在7mmol/L以下等，同时根据肾盂肾炎的病情调整抗生素的使用方案。孕妇患者的用药： 孕妇患慢性肾盂肾炎时用药需谨慎，要选择对胎儿影响小的抗生素。例如头孢菌素类药物相对较为安全，它通过抑制细菌细胞壁的合成来杀菌，对孕妇和胎儿的影响相对较小，但具体用药仍需医生根据孕妇的具体情况来权衡利弊后决定。