小肠炎的症状多样，常见的有腹痛，一般是肚脐周围隐痛，疼痛程度不一，有的轻微，有的较明显。腹泻也是常见症状，每天腹泻次数可能在3~10次不等，大便性状多为稀水样便，严重时可能出现黏液便或脓血便。
消化系统症状表现
腹痛特点： 小肠炎引起的腹痛位置多集中在腹部中间偏下区域，也就是肚脐周围。疼痛性质有隐痛、胀痛等，一般疼痛程度不是特别剧烈，但会持续存在，有时可能会有阵发性加重。腹泻情况： 腹泻频率因人而异，轻度小肠炎可能每天腹泻3~5次，大便多为不成形的稀便；而病情较重时，腹泻次数会增多，可达每天10次左右，大便中可能会带有黏液，如果炎症比较严重，还可能出现脓血便。
全身症状表现
发热现象： 部分小肠炎患者会出现发热症状，体温一般在37.5℃~38.5℃之间，属于低热情况。不过也有少数患者会出现高热，体温超过38.5℃。乏力表现： 由于肠道炎症影响营养吸收以及身体处于应激状态，患者会感觉全身乏力，没什么精神，活动耐力明显下降，稍微活动就会觉得很累。
其他伴随症状
恶心呕吐： 有些小肠炎患者会伴有恶心症状，严重时可能会出现呕吐，呕吐物多为胃内容物，一般是吃进去的食物。食欲减退： 因为肠道炎症导致消化功能受影响，患者会明显感觉食欲下降，不想吃东西，对平时喜欢的食物也提不起兴趣。