一觉起来眼睛肿疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.眼部感染：如结膜炎、麦粒肿等，可能导致眼睛红肿、疼痛。可以使用抗生素眼药水或眼膏进行治疗，如左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼膏等。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼。
2.过敏：如果对某些物质过敏，如花粉、灰尘等，可能引起眼部过敏反应，导致眼睛肿疼。可以使用抗过敏药物，如氯雷他定、扑尔敏等。同时，要避免接触过敏原。
3.睡眠不足：睡眠不足或睡眠质量差可能导致眼睛肿疼。可以通过改善睡眠质量来缓解，如保持规律的作息时间、创造舒适的睡眠环境等。
4.眼部疲劳：长时间使用电脑、手机等电子设备，或阅读、写作等近距离用眼，可能导致眼部疲劳，引起眼睛肿疼。可以通过休息、眼保健操、远眺等方式缓解眼部疲劳。
5.其他原因：如外伤、眼部疾病等也可能导致眼睛肿疼。如果症状持续不缓解或伴有其他症状，如视力下降、分泌物增多等，应及时就医，进行相关检查和治疗。
需要注意的是，以上建议仅供参考，如果症状严重或持续不缓解，建议及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应注意眼部卫生，避免用眼过度，保持充足的睡眠，以预防眼部疾病的发生。