经期性头痛多与体内激素变化有关，据统计，约有60%的女性在经期会出现不同程度的头痛症状。
激素水平波动相关
雌激素变化影响： 在月经周期中，雌激素水平会发生显著波动。月经前期，雌激素水平迅速下降，这可能会导致颅内血管张力发生变化，从而引发头痛。比如，正常女性月经周期中，月经前雌激素浓度从较高水平快速回落，部分女性就会因这种变化出现头痛表现。前列腺素作用： 月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素。前列腺素除了会引起子宫收缩外，还可能作用于血管，导致脑血管扩张，进而引发头痛。而且不同女性对前列腺素的敏感程度不同，敏感者更容易出现经期头痛。
神经递质改变因素
5 - 羟色胺变化： 5 - 羟色胺是一种与情绪、疼痛感知等相关的神经递质。在经期，女性体内5 - 羟色胺的水平会发生改变。研究发现，5 - 羟色胺水平的波动可能会影响神经调节，从而诱发头痛。例如，当5 - 羟色胺分泌异常时，对疼痛的调节失衡，就容易出现经期头痛症状。内啡肽影响： 内啡肽具有镇痛等作用。在经期，内啡肽的分泌也可能会发生变化，其浓度的改变可能会影响身体对疼痛的耐受程度，进而引发头痛。部分女性在经期内啡肽分泌减少，对疼痛的耐受降低，就更易出现头痛情况。
个体差异相关因素
遗传因素： 如果家族中有女性成员有经期头痛的情况，那么其他女性发生经期头痛的风险可能会增加。这是因为遗传因素可能使个体对经期相关的激素和神经递质变化更加敏感，从而更容易出现经期头痛。比如，母亲有经期头痛病史的女儿，相对来说更易在经期出现头痛症状。生活方式因素： 一些不良的生活方式也可能诱发或加重经期头痛。比如长期睡眠不足的女性，在经期更容易出现头痛。还有压力过大的女性，经期时由于身体本身处于特殊的生理阶段，压力因素会进一步影响神经内分泌系统，增加经期头痛的发生几率。另外，饮食方面，过多摄入咖啡因的女性，在经期也可能更易出现头痛，因为咖啡因可能会影响血管功能等。