类风湿关节炎的病因目前尚未完全明确，但一般认为是遗传、环境等多种因素共同作用的结果。据研究，遗传因素在其中起到重要作用，约60%~70%的类风湿关节炎患者有遗传易感基因。
遗传因素方面
基因关联： 人类白细胞抗原（HLA） - DR4等基因与类风湿关节炎的发病密切相关。携带这些基因的人群患病风险比不携带的人群要高。比如有家族史的人群中，亲属患病的概率比普通人群高2~10倍。遗传易感性： 遗传因素不是单一基因决定发病，而是多个基因共同作用增加患病易感性。这些基因会影响免疫系统的功能，使得机体更容易出现免疫紊乱，从而引发类风湿关节炎。
环境因素影响
感染因素： 某些病原体感染可能触发类风湿关节炎。例如，EB病毒、支原体、细菌等感染可能与类风湿关节炎的发病有关。有研究发现，在类风湿关节炎患者的滑膜组织中曾发现过EB病毒的相关成分，提示EB病毒感染可能参与了疾病的发生发展。吸烟因素： 吸烟是类风湿关节炎的一个重要环境危险因素。吸烟者患类风湿关节炎的风险比不吸烟者高1.5~3倍。香烟中的一些成分会影响免疫系统，导致免疫细胞功能异常，增加发病几率。
免疫因素作用
免疫细胞异常： 免疫系统中的T细胞、B细胞等免疫细胞功能失调。T细胞会分泌异常的细胞因子，影响免疫反应的平衡。B细胞会产生过多的自身抗体，如类风湿因子（RF）等，这些自身抗体攻击自身的关节组织，导致关节出现炎症、肿胀、疼痛等一系列类风湿关节炎的症状。免疫调节失衡： 正常情况下，免疫系统的调节是平衡的，但在类风湿关节炎患者体内，这种平衡被打破。免疫调节因子的异常使得免疫反应过度激活，持续攻击关节滑膜等组织，造成关节的慢性炎症损伤，进而逐渐破坏关节结构，影响关节功能。