甲减即甲状腺功能减退症，主要是由于各种原因导致甲状腺激素合成、分泌或生物效应不足所引起的全身性低代谢综合征。其中，自身免疫损伤是导致甲减常见的原因之一，像自身免疫性甲状腺炎，如桥本甲状腺炎，约占全部甲减病因的90%左右。
自身免疫因素相关
自身免疫性甲状腺炎： 比如桥本甲状腺炎，是一种常见的自身免疫性疾病。在这种疾病中，人体的免疫系统错误地攻击甲状腺组织，使得甲状腺细胞受到破坏，从而影响甲状腺激素的正常合成与分泌。患者体内会产生针对甲状腺的自身抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和甲状腺球蛋白抗体（TgAb），这些抗体水平的升高往往提示存在自身免疫性甲状腺炎的可能。其他自身免疫性疾病关联： 一些其他的自身免疫性疾病也可能与甲减的发生有关联。例如，1型糖尿病患者同时发生甲减的概率比普通人要高，这可能是因为自身免疫机制在多个内分泌器官上有异常表现，影响了甲状腺的功能。
甲状腺破坏相关
放射性碘治疗后： 对于一些甲状腺疾病，如甲状腺功能亢进症，在进行放射性碘治疗时，放射性碘会破坏甲状腺细胞。如果治疗剂量掌握不当或者患者自身甲状腺对放射性碘的敏感性不同，就可能导致甲状腺组织被过度破坏，从而引起甲减。一般在放射性碘治疗后的数月至数年，部分患者会逐渐出现甲减的症状。手术治疗后： 当因甲状腺结节、甲状腺癌等疾病进行甲状腺手术时，如果切除甲状腺组织过多，就会导致甲状腺激素分泌不足，引发甲减。例如，甲状腺癌患者进行甲状腺全切或近全切手术后，几乎都需要长期补充甲状腺激素来维持正常的甲状腺功能。
碘摄入异常相关
碘缺乏： 碘是合成甲状腺激素的重要原料。如果长期处于碘缺乏的环境中，比如一些远离海洋的内陆地区，饮食中碘摄入不足，就会影响甲状腺激素的合成，进而导致甲减的发生。在一些严重碘缺乏地区，地方性甲状腺肿和甲减的发病率会明显升高。一般来说，成人每天碘的适宜摄入量约为150微克，儿童和孕妇等特殊人群摄入量会有所不同。碘过量： 虽然碘缺乏会导致甲减，但碘过量也可能引起甲状腺功能异常。短期内大量摄入碘，可能会干扰甲状腺激素的正常合成与释放，导致甲状腺功能减退。比如一些人盲目补充大量含碘的保健品，就可能出现这种情况。不过，碘过量引起甲减相对碘缺乏来说较为少见，但也需要引起重视。