餐后三小时比两小时血糖高可能与多种因素有关。一般来说，人体血糖在进餐后会有波动，正常情况下餐后两小时血糖应低于7.8mmol/L，餐后三小时接近空腹血糖水平。而出现餐后三小时比两小时血糖高的情况，可能有以下原因：
胰岛素分泌调节因素
胰岛素分泌峰值延迟：正常人体进餐后，胰岛素会在一定时间内分泌增加来降低血糖，一般在餐后30 - 60分钟达到分泌峰值。如果胰岛素分泌峰值出现延迟，那么在餐后两小时时胰岛素分泌相对不足，血糖下降不明显，而到了餐后三小时，胰岛素分泌可能逐渐达到相对较高水平，对血糖的降低作用更明显，但如果基础血糖调节存在问题，就可能出现餐后三小时比两小时血糖高的情况。例如一些存在胰岛素分泌功能异常的人群，就可能出现这种胰岛素分泌时相的改变。胰岛素抵抗变化：胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低。在进餐后，身体对胰岛素的需求会变化。如果餐后两小时时胰岛素抵抗相对较强，血糖下降缓慢，而到了餐后三小时，胰岛素抵抗可能有所减轻，但是如果同时存在其他因素影响，比如肝脏糖异生等情况，就可能导致餐后三小时血糖相对两小时更高。比如肥胖人群往往存在一定程度的胰岛素抵抗，就可能出现这种血糖变化情况。
饮食相关因素
食物组成差异：如果餐后两小时吃的食物升糖指数相对较低，而餐后三小时吃的食物升糖指数相对较高，也可能出现这种情况。例如，餐后两小时吃了较多富含膳食纤维的食物，如全麦面包，升糖相对缓慢，血糖上升幅度小；而餐后三小时吃了一些精制碳水化合物，如白米饭，升糖指数高，就可能导致餐后三小时血糖比两小时高。另外，如果餐后两小时摄入的食物量较少，血糖上升幅度小，而餐后三小时摄入了额外的食物，也会使血糖升高。
疾病相关因素
糖尿病患者病情影响：对于糖尿病患者来说，血糖调节能力较差。如果糖尿病患者的血糖控制不稳定，存在空腹血糖偏高的情况，那么餐后三小时血糖可能受空腹高血糖的影响，相对餐后两小时血糖更高。比如一些2型糖尿病患者，夜间出现了苏木杰现象（夜间低血糖后反跳性高血糖），可能导致空腹血糖升高，进而影响到餐后三小时的血糖水平，使得餐后三小时血糖比两小时高。另外，一些患有内分泌疾病影响血糖调节的患者，如甲状腺功能减退患者，甲状腺素分泌减少，会影响机体的代谢，包括血糖代谢，也可能出现这种餐后血糖的异常变化。