扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型、HPV - 5型等亚型。一般来说，当人体皮肤黏膜有破损时，HPV就容易入侵并感染上皮细胞，从而引发扁平疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接接触，就有可能被感染。例如，和扁平疣患者握手、共用毛巾等，都存在感染风险。间接接触传播： 通过接触被患者污染的物品，像共用的文具、餐具等，也可能间接感染HPV，进而患上扁平疣。
易感人群特点
青少年和儿童： 这个年龄段的人群免疫系统相对还不够完善，皮肤的屏障功能也相对较弱，所以更容易感染HPV引发扁平疣。据统计，青少年患扁平疣的概率比成年人要高一些。免疫力低下者： 比如患有某些疾病导致免疫力下降的人，像艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，他们抵抗HPV感染的能力减弱，也就更容易患上扁平疣。
皮肤状态与发病关系
皮肤有外伤时： 当皮肤出现擦伤、抓伤等外伤情况时，HPV更容易侵入皮肤。比如孩子玩耍时不小心擦伤了皮肤，这时候如果接触到了HPV，就增加了患扁平疣的可能性。皮肤潮湿多汗环境： 长期处于皮肤潮湿多汗的环境中，皮肤的屏障功能会受到一定影响，也会使感染HPV引发扁平疣的几率增加。例如，一些经常运动出汗较多的人，如果皮肤没有及时清洁干爽，就可能更容易长扁平疣。