脸上长扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-3型等亚型。一般来说，当皮肤有微小破损时，病毒就容易入侵并感染上皮细胞，从而引发扁平疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接握手等接触，就有可能被传染。要是自身皮肤有破损，感染风险会更高。间接接触传播： 接触被患者污染的物品，像共用毛巾、脸盆等，也可能感染病毒长出扁平疣。
自身因素影响
免疫力低下人群： 当人体免疫力较弱时，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病等情况，身体抵御HPV的能力下降，就更容易感染HPV长出扁平疣。例如，长期熬夜的人，免疫系统功能会受到影响，相比作息规律的人更易长扁平疣。皮肤屏障受损者： 皮肤受到外伤、晒伤等导致屏障功能受损时，HPV更容易侵入皮肤细胞，进而引发扁平疣。比如皮肤被擦伤后，没有及时处理好，就可能增加长扁平疣的几率。
环境因素作用
公共卫生环境差： 在卫生条件不佳的公共场合，如公共浴室、游泳池等，接触到HPV的机会增多，感染长扁平疣的可能性也就增大。比如在公共浴室中，若有扁平疣患者使用过的物品未彻底消毒，其他人接触后就易被感染。季节变化影响： 部分人在季节更替时，皮肤状态变化，也可能诱发扁平疣。比如春季气温变化较大，皮肤的适应性若跟不上，就可能因为病毒感染长出扁平疣。