跑步时膝盖受伤后，需要采取以下措施来保护膝盖：
1.休息：停止跑步，给膝盖足够的时间恢复。避免继续跑步或进行其他高强度的运动，以免加重伤势。
2.冰敷：在受伤后的72小时内，用冰袋或冷毛巾敷在膝盖上，每次15-20分钟，每天数次。冰敷可以减轻疼痛和肿胀。
3.加压包扎：使用弹性绷带包扎膝盖，适当加压，但不要过紧。包扎可以提供支撑，减少肿胀。
4.抬高患肢：将受伤的膝盖抬高，高于心脏水平，有助于减轻肿胀。
5.使用药物：可以服用非甾体类抗炎药（如布洛芬）来缓解疼痛和减轻炎症。如果疼痛严重，医生可能会建议使用更强效的药物。
6.物理治疗：在医生的指导下，可以进行物理治疗，如电疗、热疗、超声波等，帮助缓解疼痛和促进恢复。
7.恢复训练：在膝盖恢复到一定程度后，可以逐渐开始恢复训练。可以先进行低强度的活动，如骑自行车或游泳，然后逐渐增加跑步的强度和距离。
8.加强膝盖周围肌肉的锻炼：通过进行股四头肌、腿弯肌等肌肉的强化训练，可以增强膝盖的稳定性，减少受伤的风险。
9.注意姿势：保持正确的跑步姿势，避免过度内旋或外旋膝盖。跑步时步伐适中，不要过大或过小。
10.选择合适的跑鞋：选择适合自己脚型和跑步方式的跑鞋，提供良好的支撑和缓冲。
11.定期检查：如果膝盖疼痛持续不缓解或加重，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。
需要注意的是，每个人的伤势和恢复情况可能不同，因此在采取保护措施时，最好遵循医生或物理治疗师的建议。此外，预防膝盖受伤也非常重要，包括充分热身、逐渐增加跑步强度、保持良好的身体状态等。