过敏原和食物不耐受检查存在区别。过敏原检查是患者进食某种食物后免疫系统产生排斥反应；食物不耐受检查是对特定食物成分产生不良反应且患者不能完全消化食物导致身体有抵抗反应。两者最大区别在于过敏原发作快、症状明显，主要影响皮肤、呼吸道与消化系统，食物不耐受反应慢、过程长且表现不明显。
一、过敏原检查：针对常出现过敏又不明原因的病症，如荨麻疹、过敏性哮喘等，可明确自身对何种食物过敏，从而尽量避免接触或食用，降低过敏症状复发几率。
1.主要用于确定过敏的食物。
2.能帮助患者避免相关食物以减少过敏发作。
二、食物不耐受检查：主要针对消化系统，检查是否有压痛、肌紧张等症状，也可在医生指导下通过胃镜、肠镜等检查了解是否存在幽门螺杆菌感染情况。
1.侧重于消化系统的状况。
2.借助多种检查手段来明确相关问题。
患者了解自身食用哪些食物会引起过敏后，在生活中要注意禁食这类食物，平时多吃富含维生素C的食物，保持规律作息时间。
总之，过敏原检查和食物不耐受检查在原理、症状表现等方面均有不同，各自针对不同的情况和病症进行检查和诊断，患者应根据自身具体状况进行相应检查和应对，以维护身体健康。