口腔溃疡可以使用局部用药来缓解，一般7~10天能自愈。比如西瓜霜喷剂，直接喷在溃疡处，能起到消肿止痛的作用。
局部用药缓解
含漱类药物： 氯己定含漱液是常见的含漱药，它能杀灭口腔内的细菌，抑制菌斑形成，每天含漱2~3次，每次10毫升左右，含漱1分钟后吐出。贴片类药物： 醋酸地塞米松粘贴片可用于非感染性口腔溃疡，将贴片贴于溃疡处，能起到抗炎、减轻水肿的作用，但连续使用不要超过7天。
促进愈合的药物
生长因子类： 重组人表皮生长因子凝胶能促进口腔溃疡创面的愈合，直接涂抹在溃疡表面，每天使用2~3次。中药类： 冰硼散也是常用的治疗口腔溃疡的中药，取适量吹敷于溃疡处，有清热解毒、消肿止痛的功效，但儿童使用时要注意用量，避免过量。
针对病因用药
维生素缺乏引起： 如果是因缺乏维生素B₂导致的口腔溃疡，可以适当补充维生素B₂片，一般成人每天服用3次，每次5毫克。但要注意不能长期大量服用，以免引起不良反应。免疫力低下引起： 对于因免疫力低下引发的口腔溃疡，可在医生指导下使用转移因子口服液等调节免疫力的药物，但儿童使用转移因子口服液时要遵医嘱，根据年龄和体重调整剂量。