上门牙两颗中间的肉肿起来了，可能是以下原因引起：
1.牙根尖周炎：多由龋齿发展而来，炎症可从牙髓腔扩散至牙根周围组织，导致牙龈肿胀、疼痛。此时需要进行根管治疗，清除根管内的感染物质，以缓解症状。
2.牙周炎：是侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由菌斑、牙石、创伤性咬合等引起，可导致牙龈红肿、出血、牙周袋形成、牙槽骨吸收、牙齿松动等。治疗需要进行牙周洁治和刮治，去除菌斑、牙石等刺激物，并使用抗生素（如甲硝唑、阿莫西林等）控制炎症。
3.牙龈乳头炎：多由食物嵌塞、不良修复体等刺激引起，表现为牙龈乳头红肿、疼痛，触痛明显。治疗主要是去除刺激物，用复方氯己定含漱液漱口，必要时口服抗生素（如头孢呋辛酯、红霉素等）。
4.牙龈瘤：是牙龈上特别是龈乳头处局限生长的炎性反应性瘤样增生物，与内分泌、局部刺激等因素有关，质地柔软，色暗红，易出血。治疗主要是手术切除，术后需要定期复查。
5.其他：如白血病、维生素C缺乏症等全身性疾病也可导致牙龈肿胀，需要针对病因进行治疗。
如果上门牙两颗中间的肉肿起来了，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意口腔卫生，养成早晚刷牙、饭后漱口的习惯，定期进行口腔检查和洁治。