骨髓炎主要是由细菌等病原体感染引起的。一般来说，约50%的骨髓炎是由金黄色葡萄球菌感染导致的。
创伤性因素引发
开放性骨折：当骨骼发生开放性骨折时，比如骨折处皮肤有破损，外界的细菌就很容易直接侵入骨骼内部引发感染。像一些严重的车祸导致的骨折，骨折断端暴露在外面，细菌就有可乘之机进入骨头，从而引发骨髓炎。手术创伤：在进行骨科手术时，如果手术过程中消毒不严格，或者术后护理不当，也可能让细菌感染骨骼。例如，一些关节置换手术，要是手术室的消毒达不到标准，就可能在术后引发骨髓炎。
血源性感染导致
身体其他部位感染蔓延：当身体其他部位有感染病灶时，比如皮肤疖肿、扁桃体炎等，细菌可能会进入血液循环，随着血液流动到达骨骼部位。像皮肤疖肿里的金黄色葡萄球菌，就有可能通过血液跑到骨头里，在骨骼处定植繁殖，引起骨髓炎。儿童时期发生血源性骨髓炎的几率相对较高，因为儿童的骨骺血管丰富，细菌更容易停留繁殖。免疫力低下人群易感染：本身免疫力比较低的人，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病的人，身体抵御细菌的能力减弱，更容易受到血源性感染引发骨髓炎。糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的抗感染能力下降，细菌就更容易在骨骼部位滋生。
临近感染直接蔓延
软组织感染波及：如果邻近骨骼的软组织发生感染，如蜂窝织炎等，感染可能会直接向骨骼蔓延。比如小腿部位的蜂窝织炎，炎症可能会慢慢侵袭到下面的骨骼，引发骨髓炎。骨关节感染扩散：相邻的骨关节感染也可能扩散到骨骼。例如膝关节的感染，如果没有得到及时控制，炎症可能会扩散到周围的骨骼，导致骨髓炎的发生。