治毛囊炎常用的药物有抗生素类、抗真菌类等。一般来说，外用药物和口服药物是常见的治疗方式。
外用药物治疗
局部涂抹抗生素药膏： 对于细菌感染引起的毛囊炎，常用莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，帮助缓解炎症。比如皮肤出现单个或多个红色丘疹、脓疱等症状时，可将药膏薄薄涂抹在患处。还有夫西地酸乳膏，也可用于治疗细菌感染导致的毛囊炎，能减轻局部的红肿、疼痛等症状。抗真菌药膏： 如果是真菌感染引起的毛囊炎，像酮康唑乳膏就比较适用。它可以抑制真菌的生长繁殖，适用于由马拉色菌等真菌感染引发的毛囊炎。使用时均匀涂抹在受感染的部位。
口服药物治疗
抗生素类口服药： 当毛囊炎比较严重，或者外用药物效果不佳时，可能会用到口服抗生素。比如头孢类抗生素，不过具体使用哪种需要医生根据病情判断。头孢类抗生素能通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用，从而治疗细菌感染导致的毛囊炎。还有大环内酯类的红霉素等，也可用于治疗毛囊炎，它可以阻碍细菌蛋白质的合成，达到抗菌的效果。抗真菌口服药： 若是真菌感染较为顽固的情况，可能会使用抗真菌口服药，像伊曲康唑。但这类药物需要在医生的严格指导下使用，因为它有一定的副作用和用药禁忌，比如肝功能不全者要谨慎使用等。伊曲康唑能抑制真菌细胞色素P450酶系统，影响真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。
其他注意事项
日常护理配合： 在用药治疗毛囊炎的同时，还需要注意日常护理。保持皮肤清洁干燥很重要，每天用温水清洗患处，但要注意不要过度清洁，以免损伤皮肤屏障。比如油性皮肤的人，更要注意清洁油脂，但也不能用刺激性强的清洁剂。另外，要避免搔抓患处，防止感染扩散。如果是毛发部位的毛囊炎，如头皮毛囊炎，要注意头发的清洁，勤洗头，选择温和的洗发水。特殊人群情况： 对于儿童患者，使用药物要特别谨慎。儿童的皮肤和身体代谢与成人不同，像一些外用抗生素药膏，也要在医生指导下使用，避免使用不当对儿童皮肤造成不良影响。孕妇如果患有毛囊炎，用药更要格外小心，需咨询医生，选择对胎儿影响最小的治疗方案，因为很多药物可能会通过胎盘影响胎儿发育。