强直性脊柱炎是一种慢性炎症性疾病，主要累及脊柱、骶髂关节等中轴关节。其发病与遗传、免疫等多种因素相关，约90%的患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）阳性有关，HLA - B27阳性人群中约10%会发展为强直性脊柱炎。
遗传因素方面
家族遗传倾向：强直性脊柱炎具有明显的家族遗传聚集现象。如果家族中有亲属患有强直性脊柱炎，那么其直系亲属（如子女）患病的风险比普通人群高很多。研究发现，患者一级亲属（父母、子女、兄弟姐妹）中强直性脊柱炎的患病率比一般人群高20 - 40倍。遗传基因作用：HLA - B27基因是与强直性脊柱炎发病密切相关的基因。携带HLA - B27基因的人，发生强直性脊柱炎的概率远高于不携带该基因的人，但并不是携带HLA - B27基因就一定会发病，只是发病风险增加。
免疫因素方面
免疫系统异常激活：在强直性脊柱炎患者体内，免疫系统会出现异常激活的情况。免疫系统中的一些细胞因子，如肿瘤坏死因子 - α（TNF - α）等会过度分泌。这些异常分泌的细胞因子会导致关节部位的炎症反应，进而引起脊柱、骶髂关节等部位的炎症损伤，出现疼痛、僵硬等症状，长期发展还会导致关节的结构破坏和畸形。自身免疫攻击：患者的免疫系统会错误地将自身关节组织当作外来异物进行攻击，导致关节滑膜、软骨等组织受到损伤，引发炎症，影响关节的正常功能。
感染因素方面
肠道细菌感染影响：某些肠道细菌感染可能与强直性脊柱炎的发病有关。例如，肺炎克雷伯菌等肠道细菌的某些成分与人体自身组织有相似的抗原结构，当人体感染这类细菌后，免疫系统在攻击细菌时，可能会误伤到自身关节组织，引发强直性脊柱炎相关的炎症反应。有研究表明，强直性脊柱炎患者中肠道肺炎克雷伯菌的携带率高于正常人群。其他感染的关联：虽然目前对于其他感染与强直性脊柱炎的具体关联研究还在进行中，但一些病毒感染等也被认为可能在强直性脊柱炎的发病过程中起到一定的诱发作用。不过相对来说，肠道细菌感染与强直性脊柱炎的关系研究更为明确。