肠道菌群失调时可能出现多种症状。据相关研究显示，约30% - 50%的肠道菌群失调患者会出现消化系统方面的表现。
消化系统症状
腹痛腹泻： 肠道菌群失衡可能导致肠道蠕动紊乱，部分人会出现腹痛，疼痛程度不一，可为隐痛或绞痛。同时，腹泻较为常见，每天排便次数可能增多，甚至可达3 - 5次或更多，粪便质地稀软，可能呈水样便等。腹胀便秘： 有的患者会感觉腹部胀满不适，这是因为菌群失调影响了肠道的正常消化吸收和气体代谢。而便秘情况也时有发生，排便间隔时间延长，如原本1 - 2天排便一次，变为3 - 4天甚至更久才排便一次，粪便干结，难以排出。
全身症状表现
免疫力下降： 肠道菌群与人体免疫力密切相关，菌群失调后，人体抵御外界病菌等的能力可能减弱。比如平时更容易感冒，一年中感冒次数可能比菌群正常时增加，像原本一年感冒1 - 2次，现在可能增加到3 - 4次甚至更多。疲劳乏力： 由于肠道功能紊乱，营养吸收受到一定影响，身体得不到充足的能量供应等，患者会经常感到疲倦、乏力，即使休息后也难以恢复精力，日常活动容易出现力不从心的感觉。
其他相关症状
情绪异常： 肠道被称为第二大脑，肠道菌群失调可能影响神经递质的合成等，进而导致情绪方面的变化。部分患者会出现情绪低落、焦虑等情况，比如原本性格开朗的人，可能变得容易烦躁、抑郁等。皮肤问题： 肠道菌群失调还可能反映在皮肤上，出现皮肤粗糙、长痘、瘙痒等问题。这是因为肠道内环境改变后，一些代谢产物等可能影响皮肤的状态，例如原本皮肤光滑的人，可能出现脸部或身体其他部位长痘的情况。