生理性黄疸和病理性黄疸主要有以下区别。通常新生儿出生后2 - 3天开始出现生理性黄疸，4 - 5天达到高峰，7 - 14天消退，早产儿持续时间可能稍长，一般不超过3周，而且宝宝精神、吃奶等一般情况良好。
出现时间与消退时间：
生理性黄疸： 大多在出生后2 - 3天出现，4 - 5天达到高峰，7 - 14天消退，早产儿持续时间可能延长，最长不超过4周。病理性黄疸： 出现时间较早，可能在出生后24小时内就出现；而且消退时间晚，足月儿超过2周仍不消退，早产儿超过4周仍不消退，或者消退后又再次出现。
黄疸程度：
生理性黄疸： 足月儿血清胆红素浓度一般不超过221μmol/L（12.9mg/dl），早产儿一般不超过257μmol/L（15mg/dl）。病理性黄疸： 血清胆红素浓度较高，足月儿超过221μmol/L（12.9mg/dl），早产儿超过257μmol/L（15mg/dl），或者每日血清胆红素升高超过85μmol/L（5mg/dl）。
伴随症状：
生理性黄疸： 宝宝一般情况良好，除了皮肤、巩膜黄染外，没有其他明显不适症状，精神状态好，吃奶正常。病理性黄疸： 可能伴有其他症状，比如精神萎靡、嗜睡、拒奶、哭闹不安等，还可能伴随其他疾病的表现，像感染时可能有发热等症状。
病因：
生理性黄疸： 主要是因为新生儿出生后，体内红细胞破坏增多，胆红素产生增加，而肝脏对胆红素的代谢功能还不完善，导致胆红素在体内积聚引起的，属于正常的生理现象。病理性黄疸： 常见的病因有新生儿溶血病，由于母婴血型不合，母亲的抗体通过胎盘进入胎儿体内，破坏胎儿红细胞；还有感染因素，比如新生儿败血症等，病原体感染后影响胆红素的代谢；另外，胆道畸形等也会导致病理性黄疸，使得胆红素排泄出现障碍。