肱二头肌长头肌腱炎的治疗方法有多种。一般来说，可通过保守治疗和手术治疗等方式来处理。其中保守治疗应用较为广泛。
物理治疗缓解
休息与制动： 患者需要适当休息，避免过度使用肩部，尤其是那些会加重肌腱炎症状的动作，比如频繁的上臂前屈、外展等动作。让肩部得到充分的放松，有助于炎症的减轻。热敷： 可以用温热的毛巾或热水袋进行局部热敷，每天可进行3 - 4次，每次热敷15 - 20分钟，通过促进局部血液循环，缓解肌腱的紧张和炎症。冷敷： 在炎症急性发作期，如疼痛、肿胀明显时，可进行冷敷，每次冷敷10 - 15分钟，每天3 - 4次，能减轻肿胀和疼痛。超声波治疗： 利用超声波的温热效应和机械效应，促进肌腱组织的修复，减轻炎症反应，一般需要在专业医疗机构由医生操作进行。
药物辅助治疗
非甾体抗炎药： 像布洛芬等非甾体抗炎药物可以起到消炎止痛的作用，能缓解肌腱炎引起的疼痛和炎症，但要注意这类药物可能会有一些胃肠道不适等副作用，需在医生指导下使用。不过儿童等特殊人群使用时要格外谨慎，避免自行用药。局部外用药物： 例如双氯芬酸二乙胺乳胶剂等，可直接涂抹在肩部疼痛部位，通过皮肤吸收发挥抗炎止痛作用，相对口服药物来说，全身副作用可能较小。
康复锻炼促进恢复
肩部拉伸锻炼： 进行肩部的缓慢拉伸动作，比如站立位，手臂自然下垂，然后慢慢将手臂向身体后方伸展，保持15 - 30秒，重复多次；或者面对墙壁，手指慢慢向上爬行，逐渐提高肩部的活动范围，帮助恢复肌腱的柔韧性，但要注意动作幅度和力度，避免过度拉伸加重损伤。肩部力量锻炼： 在疼痛缓解后，可以进行一些肩部力量锻炼，如利用弹力带进行肩部外展、前屈等方向的抗阻练习，增强肩部周围肌肉力量，从而更好地稳定肱二头肌长头肌腱，一般每周可进行3 - 4次力量锻炼，每次15 - 20分钟。不过锻炼要循序渐进，根据自身情况调整强度。
手术治疗情况
手术适应证： 对于经过长时间保守治疗无效，肌腱炎症严重、出现明显撕裂等情况的患者，可能需要考虑手术治疗。但手术并不是首选，只有在保守治疗效果不佳时才会考虑。手术方式主要是对受损的肌腱进行修复等操作，术后也需要较长时间的康复训练来恢复肩部功能。