男性感染衣原体后，部分人可能在1~3周左右出现症状。常见的症状主要体现在尿道、生殖系统等方面。
尿道不适症状
尿频、尿急： 男性感染衣原体后，早期可能会出现尿频的情况，即排尿次数比平时增多。随着病情发展，还可能伴随尿急，总是感觉有尿意，迫不及待要排尿。一般每小时可能会有几次排尿冲动，但每次尿量并不多。尿道分泌物： 尿道口可能会有少量稀薄的分泌物，初期分泌物可能较清，颜色接近透明，量也较少。随着病情进展，分泌物可能会变得稍黏稠，颜色可能略显黄白。有的男性晨起时会发现尿道口有少量分泌物结痂，封住尿道口。
生殖系统相关症状
附睾炎： 部分男性衣原体感染可能会引发附睾炎，表现为附睾部位疼痛、肿胀。疼痛可放射至阴囊、腹股沟等部位。用手触摸附睾时，能明显感觉到附睾肿大、触痛明显。一般单侧发病较为常见，但也有双侧发病的情况。前列腺炎： 感染衣原体还可能影响前列腺，导致前列腺炎。患者会出现会阴部坠胀不适，有时会有下腹部隐痛。部分人还可能出现排尿后尿道不适或灼热感加重等情况，并且可能会影响精液质量，对生育产生一定影响。
其他可能症状
全身症状： 少数男性衣原体感染可能会出现轻微的全身症状，比如低热，体温一般在37.5℃~38℃左右，不过这种情况相对较少见。还有些人可能会感觉全身乏力、疲倦，但这些全身症状往往不太明显，容易被忽视。需要注意的是，男性感染衣原体后的症状表现存在个体差异，有的人症状可能较轻，容易被忽视，从而耽误治疗。如果出现上述类似症状，应及时就医进行相关检查，如衣原体检测等，以便早发现早治疗。