三个月宝宝出现咳嗽，通常要考虑急性上呼吸道感染、肺炎以及胃食管反流等情况，也不排除百日咳等其他原因。具体如下：
一、急性上呼吸道感染
1.多由病毒感染引起，一般可自行痊愈，无需特殊治疗。咳嗽其实是身体排出病菌的一种正常方式，不建议给宝宝使用镇咳药，可通过让宝宝直接服用蜂蜜或热梨汤等方式来缓解症状。
2.但若症状较为严重，就需要家长尽快带宝宝就医，明确病因后进行对症治疗。
二、肺炎
1.常见原因是细菌感染，其典型症状为咳嗽，常伴有发热、气促、喘息等表现。
2.症状较轻时，可依据病因使用抗感染药物，如阿莫西林；若考虑细菌感染可能性较大，可遵医嘱使用青霉素、头孢唑肟等药物进行抗感染。同时还可进行吸痰、雾化等对症支持治疗。
3.病情严重时，可在医生指导下使用呼吸机进行呼吸支持。
三、胃食管反流
1.这种病也常导致宝宝咳嗽，一般在夜间和清晨较为明显，多为刺激性呛咳。
2.此时可将宝宝头部适当抬高约30°，并让宝宝侧卧，同时做到少吃多餐。可遵医嘱服用抑酸药，如西咪替丁等；胃肠黏膜保护剂，如硫糖铝、磷酸铝凝胶等。
3.若经保守治疗6至8周无效，或者有其他合并症状，可考虑选择外科手术进行治疗。
总之，当三个月宝宝咳嗽时，要综合考虑多种可能原因，及时就医，以便明确诊断并采取合适的治疗措施。