胃底静脉曲张主要是由门静脉高压引起的，约90%以上的胃底静脉曲张是因肝硬化导致门静脉高压所致。正常门静脉压力约为5-10mmHg，当门静脉高压时，压力超过10mmHg，就容易引发胃底静脉曲张。
肝硬化相关因素
病毒性肝炎导致肝硬化
乙肝病毒感染：乙肝病毒长期感染肝脏，会引起肝细胞炎症、坏死，逐步发展为肝硬化。据统计，全球约有2.57亿乙肝病毒携带者，其中部分会进展为肝硬化，进而出现胃底静脉曲张。丙肝病毒感染：丙肝病毒感染后约有50%-85%会发展为慢性肝炎，继而进展为肝硬化，也是导致门静脉高压引发胃底静脉曲张的常见原因之一。
酒精性肝硬化
长期大量饮酒是重要诱因，每日饮酒量超过80g（乙醇含量），持续10年以上就容易引发酒精性肝病，进而发展为肝硬化。比如，长期每天摄入500ml高度白酒，持续5年以上，患酒精性肝硬化的风险会显著增加，从而可能导致胃底静脉曲张。
其他少见原因
门静脉血栓形成
门静脉主干或其分支发生血栓，会导致门静脉血流受阻，引起门静脉高压，进而引发胃底静脉曲张。门静脉血栓形成可能与血液高凝状态、腹部外伤、胰腺炎等因素有关。例如，有腹部手术史的患者，术后发生门静脉血栓的风险相对较高，一旦形成血栓就可能引发相关并发症。
布加综合征
这是由于肝静脉或其开口以上的下腔静脉阻塞引起的门静脉高压症。主要是因为下腔静脉内膜炎、血栓形成等原因导致血管阻塞，使门静脉回流受阻，从而出现胃底静脉曲张等表现。患者可能会有右上腹疼痛、肝大等症状。