慢性肠胃炎常见症状多样。一般来说，患者会有长期反复发作的腹痛，疼痛程度多为隐痛或胀痛，可持续数周甚至数月不等。部分患者还会出现消化不良的表现，比如食欲减退，大约有30% - 50%的慢性肠胃炎患者会有不同程度的食欲下降情况，还可能出现餐后饱胀、嗳气等症状。
腹痛特点
隐痛为主： 慢性肠胃炎引起的腹痛大多是隐隐作痛，疼痛没有剧烈的绞痛感，位置多在腹部正中或脐周附近。时轻时重： 腹痛症状会有波动，有时候疼痛较轻，患者还能正常进行日常活动，但在进食某些刺激性食物后，疼痛可能会加重。
消化不良表现
食欲减退： 患者对食物的兴趣降低，看到平常喜欢的食物也没有想吃的欲望，而且这种食欲减退的情况会持续较长时间，可能会影响患者的营养摄入。餐后饱胀： 进食少量食物后就感觉胃部饱胀，即使没吃多少东西，也会觉得肚子很胀，这种情况会持续数小时，影响患者后续的进食。
其他常见症状
腹泻或便秘： 部分慢性肠胃炎患者会出现腹泻症状，大便次数增多，可能每天3 - 5次，大便质地较稀，呈糊状或水样；而另一部分患者则会出现便秘，大便干结，排便困难，每周排便次数少于3次。恶心呕吐： 有些患者会有恶心的感觉，严重时可能会出现呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般呕吐后症状可能会有所缓解，但容易反复出现。