脑出血后遗症的发病原因主要与脑出血本身的损伤及后续恢复情况等多方面因素相关。一般来说，脑出血后局部脑组织受损，后续恢复过程中可能因多种因素导致后遗症出现。
一、基础疾病影响
高血压： 约70%的脑出血患者有高血压病史，长期高血压会使脑内小动脉发生玻璃样变、纤维素样坏死，形成微动脉瘤，当血压骤然升高时，微动脉瘤破裂就会引发脑出血。如果高血压控制不佳，脑出血复发风险高，进而增加后遗症发生几率。例如，长期高血压未得到有效控制的患者，脑出血后出现肢体运动障碍等后遗症的可能性相对更大。动脉硬化： 动脉硬化会使脑血管弹性降低，血管壁变脆，容易在血压波动等情况下破裂出血。随着年龄增长，动脉硬化发生率逐渐升高，60岁以上人群动脉硬化相关的脑出血更易遗留后遗症。
二、脑出血损伤程度
出血部位： 若脑出血发生在重要功能区，如基底节区、脑干等，后遗症出现的概率及严重程度往往更高。比如脑干出血，即使出血量不大，也可能导致严重的肢体瘫痪、意识障碍等后遗症。而出血部位相对非功能区的患者，后遗症相对较轻。一般来说，基底节区出血后约有半数患者会遗留不同程度的肢体活动受限等后遗症。出血量： 出血量较大时，对脑组织的破坏范围广，周围脑组织水肿明显，会加重脑损伤。出血量超过30毫升的患者，发生脑出血后遗症的可能性比出血量小于10毫升的患者高很多。比如出血量超过60毫升的患者，多数会遗留较为严重的认知、肢体等多方面后遗症。
三、康复治疗因素
康复治疗开始时间： 脑出血后如果能在发病后3个月内及时进行规范的康复治疗，可明显降低后遗症发生风险。而康复治疗开始时间越晚，如超过6个月才开始康复，肢体功能等恢复效果往往较差，后遗症更明显。研究显示，发病后1个月内开始康复的患者，肢体运动功能恢复良好率比3个月后开始的高约30%。康复治疗方式： 恰当的康复治疗方式对减少后遗症至关重要。如果康复治疗方法不当，如肢体锻炼强度不合适等，可能导致肌肉萎缩、关节僵硬等后遗症。比如正确的运动康复训练能帮助患者恢复肢体运动功能，而不规范的训练可能适得其反，加重后遗症程度。