小孩扁桃体肥大的治疗需根据具体情况而定。一般来说，轻度的扁桃体肥大可以先观察，而中重度的可能需要药物或手术治疗。
观察等待情况
如果小孩扁桃体肥大程度较轻，没有明显的呼吸不畅、睡眠打鼾等症状，通常可以先进行观察等待。比如，有些孩子的扁桃体肥大是生理性的，随着年龄增长可能会逐渐缩小。这期间要注意让孩子多喝水，保持口腔清洁，尽量避免反复感冒，因为感冒可能会加重扁桃体的炎症和肥大。
药物治疗方面
抗感染药物
如果扁桃体肥大是由细菌感染引起的，可能会使用抗生素。比如青霉素类抗生素，像阿莫西林等，不过使用前需要确定孩子对青霉素不过敏。一般来说，需要按照疗程使用，通常要连续用药7 - 10天左右，以彻底清除细菌感染，减轻扁桃体的炎症和肥大情况。但如果是病毒感染引起的扁桃体肥大，通常不需要使用抗生素，可让孩子多休息、对症处理，比如使用清热解毒的中成药，像蓝芩口服液等，这类药物能在一定程度上缓解扁桃体炎症，减轻肥大症状。
局部用药
还可以使用局部的喷喉药物，例如锡类散等，喷喉可以直接作用于扁桃体部位，起到消肿、消炎的作用。但局部用药时要注意孩子的配合度，年龄较小的孩子可能不太容易配合。
手术治疗情况
当小孩扁桃体肥大非常严重，已经严重影响呼吸，出现睡眠中频繁打鼾、呼吸暂停等情况，或者扁桃体肥大反复感染，一年发作7 - 8次及以上，严重影响孩子的生活质量时，可能需要考虑手术治疗。手术一般是扁桃体切除术，目前多采用低温等离子切除手术，这种手术创伤相对较小，术后恢复也相对较快。不过手术有一定的适应证和禁忌证，需要医生进行全面评估，比如要排除孩子有凝血功能障碍、严重心肺疾病等情况才能进行手术。