药物组成区别
逍遥丸主要由柴胡、当归、白芍、炒白术、茯苓、炙甘草、薄荷组成。
加味逍遥丸是在逍遥丸基础上加了牡丹皮和栀子，所以药物组成多了这两味药。
功效主治区别
逍遥丸：功效为疏肝健脾、养血调经，常用于肝郁脾虚所致的郁闷不舒、胸胁胀痛、头晕目眩、食欲减退、月经不调。从中医角度看，肝郁脾虚会影响身体的气血运行和脏腑功能，导致出现上述一系列症状，逍遥丸通过调理肝郁和脾虚来改善这些情况。
加味逍遥丸：在逍遥丸疏肝健脾、养血调经的基础上，增加了清热凉血、散瘀消痈的功效。适用于肝郁血虚、肝脾不和证，兼见有烦热、盗汗、口渴、舌红苔黄、脉弦数等有热象的患者，比如女性月经先期、月经过多，伴有乳房胀痛、烦躁易怒等有肝郁化热表现的情况。
适用人群差异
逍遥丸：一般适用于以肝郁脾虚为主要表现的人群，例如情绪抑郁、闷闷不乐，同时有食欲不振、月经不调等情况的人群，但相对来说热象不明显。不同年龄、性别的人都可能适用，只要符合肝郁脾虚的证候。对于儿童，若有符合肝郁脾虚的相关症状，但需谨慎使用，应在医生指导下根据具体情况判断；对于老年人，若存在肝郁脾虚引起的不适，也可考虑使用，但同样要在专业医师评估后应用。
加味逍遥丸：更适用于肝郁血虚且有化热表现的人群，比如女性月经周期提前，月经量较多，颜色鲜红或有血块，同时伴有心烦、口干、潮热等有热象的情况。在特殊人群中，孕妇要慎用加味逍遥丸，因为其中的一些药物成分可能对孕妇产生一定影响；对于有高血压、心脏病、肝病、糖尿病、肾病等慢性病严重者，应在医生指导下使用，因为这类人群身体状况相对复杂，需要评估药物对病情的影响；儿童、哺乳期妇女、年老体弱及脾虚便溏者等也需要在医生指导下使用，儿童由于各脏器发育尚未完善，需严格遵医嘱；哺乳期妇女使用时要考虑对乳汁及婴儿的影响；年老体弱人群和脾虚便溏者本身身体机能较弱，药物的使用需要谨慎把控。
现代药理学研究方面的区别（相对差异）
逍遥丸：现代研究发现其可能对神经系统有一定调节作用，能改善抑郁状态相关指标，还对内分泌系统有调节作用，可影响激素水平等，从而对月经不调等起到改善作用，其作用机制涉及多靶点调节身体的神经-内分泌-免疫网络等。
加味逍遥丸：除了具有逍遥丸的部分药理作用外，由于增加了牡丹皮和栀子，其清热作用在药理上可能表现为对炎症反应有一定的抑制作用，对体内的热象相关指标有调节作用，比如对一些因肝郁化热引起的炎症相关指标可能有改善作用，当然具体的药理机制还在进一步深入研究中，但总体是在逍遥丸基础上增强了清热的相关药理效应。