小脚趾外侧长茧子很疼，可能是长期摩擦或压迫导致的胼胝，也可能是鸡眼、跖疣等疾病。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.长期摩擦或压迫：小脚趾长期受到摩擦或压迫，如穿不合适的鞋子、长时间站立或行走等，会导致局部皮肤增厚形成茧子。这种情况下，去除病因，如更换合适的鞋子、避免长时间站立或行走，茧子通常会逐渐缓解。如果疼痛明显，可以使用水杨酸软膏、尿素软膏等软化角质，或使用鸡眼贴、冷冻、激光等方法去除茧子。
2.鸡眼：鸡眼是由于长期挤压和摩擦引起的角质层增厚，呈圆锥状嵌入真皮内，压迫神经末梢，走路时疼痛明显。治疗方法包括外用鸡眼膏、水杨酸软膏等，也可采用鸡眼挖除术、鸡眼切除术等方法。
3.跖疣：跖疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，可通过直接或间接接触传播。跖疣初期为针头大小的丘疹，逐渐增大至黄豆大小或更大，表面角化，粗糙不平，呈灰黄、污褐或正常肤色，界限清楚，周围绕以稍高增厚的角质环，削去表面角质层，其下有疏松的角质软芯，可见毛细血管破裂外渗凝固而形成的小黑点。治疗方法包括外用药物、冷冻、激光、手术等。
需要注意的是，以上治疗方法应在医生的指导下进行，根据具体情况选择合适的治疗方法。同时，平时应注意保持足部清洁干燥，避免长时间穿高跟鞋或尖头鞋，选择舒适的鞋子。如果茧子持续不愈或伴有其他症状，如疼痛加剧、出血、感染等，应及时就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。