例假第三天肚子疼，可能是原发性痛经、子宫内膜异位症等原因引起。以下是一些可能的原因和建议：
1.原发性痛经
原因：原发性痛经是指生殖器官无器质性病变的痛经，可能与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关。
治疗方法：
一般治疗：注意经期卫生，避免剧烈运动、过度劳累和防止受寒。
药物治疗：疼痛不能忍受时辅以药物治疗，可口服避孕药抑制排卵，减少前列腺素的产生。
2.子宫内膜异位症
原因：子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的部位，并引起的病变及症状。
治疗方法：
药物治疗：假绝经疗法，如使用戈舍瑞林，使体内的激素水平达到绝经的状态，缓解痛经。
手术治疗：有生育要求及药物治疗无效者，可行手术治疗。
如果例假第三天肚子疼的症状持续不缓解或伴有其他不适，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。此外，在例假期间，应注意保暖，避免食用生冷、辛辣等刺激性食物，保持心情愉悦，有助于缓解疼痛。