跑完步耳朵疼的原因主要有以下几点：
1.耳内压力变化：跑步时，人体血液循环加快，心跳加速，血液涌向四肢肌肉，导致耳部血管扩张，血液可渗出血管进入中耳，引起耳内压力增加，从而引发疼痛。
2.咽鼓管功能障碍：跑步时，外界空气不能进入中耳，中耳内原有的气体被逐渐吸收，导致中耳负压增加，引起耳痛。
3.外耳道耵聍（耳屎）：耵聍在外界空气的不断推动下，被推向耳道深部，从而刺激鼓膜，引起疼痛。
4.外耳道炎或中耳炎：如果本身患有外耳道炎或中耳炎，跑步时可能会因外耳道受到刺激或中耳压力变化而导致疼痛加重。
针对以上原因，可以采取以下措施缓解疼痛：
1.停止跑步，休息片刻。
2.用手轻轻按摩耳朵或拉扯耳垂，缓解耳部压力。
3.用手捂住耳朵，然后快速松开，重复几次，以平衡中耳内外压力。
4.如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如听力下降、耳鸣等，应及时就医，进行相关检查和治疗。
总之，跑完步耳朵疼可能是多种原因引起的，如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便明确病因并采取相应的治疗措施。