跑完步耳朵里面疼，可能是以下原因引起的：
1.耳内压力变化：跑步时呼吸加快，空气通过口腔和鼻子进出，导致咽鼓管开放，空气进入中耳腔，使中耳内气压增加，从而引起耳痛。
2.外耳道耵聍（耳屎）：耵聍被震松后，可能会刺激外耳道皮肤，引起疼痛。
3.外耳道炎或中耳炎：跑步时外耳道受到反复摩擦，或汗水浸渍，容易引发外耳道炎或中耳炎，导致耳痛。
4.其他：头部外伤、颞下颌关节紊乱等也可能导致跑步后耳朵疼痛。
针对不同原因引起的耳朵疼痛，治疗方法也有所不同。如果是耳内压力变化引起的疼痛，通常不需要特殊治疗，停止跑步后，疼痛会逐渐缓解。如果是外耳道耵聍引起的，可请医生使用专业工具取出。如果是外耳道炎或中耳炎，需要使用抗生素滴耳液等药物进行治疗。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如听力下降、耳鸣等，应及时就医，进行详细的耳部检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
此外，为了预防跑步后耳朵疼痛，在跑步时可以采取以下措施：
1.用手捏住鼻子，闭嘴，用力呼气，使空气通过咽鼓管进入中耳腔，平衡中耳内外气压。
2.选择合适的跑步环境，避免在空气污染严重或噪音较大的地方跑步。
3.保持耳部清洁干燥，避免耵聍栓塞。
4.如果有耳部疾病，应在医生的指导下进行治疗，病情稳定后再进行跑步等运动。
总之，跑步后耳朵疼痛可能是多种原因引起的，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。